前作「プリンス・オブ・ペルシャ～時間の砂～」から数年後・・・
「時間の砂」の入った砂時計を解き放った王子は、時間の番人ダハカに追われる身となっていた。本来その時間に属さない者は、ダハカに排除されてしまうのだ。その呪縛を断ち切るため、王子は時の島へ旅立つ。その島にある「時の門」をくぐれば、時空を超え、過去に戻ることができるのだ。そして、そこには砂を創る「時の女王」がいるという・・・。島に向かう途中、王子を襲うモンスターと謎の女。行く手に立ちはだかる数々の試練。ダハカの呪縛から逃げられるには、過去に戻り、砂の創造を防止しなければならない。果たして、王子は過去を変えることが出来るのだ。それとも死の運命に甘んじるのか！？

• 自由自在な戦闘スタイル

  二刀流や敵を飛び越えるアクロバットアクションなど、用意された戦闘アクションは60種類以上！新たな戦闘システムの採用により、様々な戦い方が可能になりました。自由自在にアクションを駆使し、究極のコンボを決めるのだ！

• 多彩な武器とアイテム

  剣、斧、鎚など、戦いの中でプリンスが操る武器は50種類以上も登場する。
  それぞれ破壊力、スピードが違う他、特殊な能力を持つ武器や隠しアイテムなどもあるぞ！

• 時間のパワーをマスターせよ！

  周囲の敵をなぎ払う「運命の息」、時間を遅らせる「嵐の目」、時間を巻き戻す「リコール」など、「時間の力」を使いこなせばさまざまな困難を切り抜けられる。過去に戻り、死を予言された剣士の運命を変えるのだ！