特殊工作員「スプリンターセル」であるサム・フィッシャーは、特殊部隊「サード・エシュロン」から与えられた任務を遂行します。潜入する場所では、敵兵士が巡回していたり、監視カメラや赤外線センサーなどの防犯設備が、行く手を阻みます。
しかし、敵の目や設備をかいくぐり、何事もなかったように目標を達成するのが「スプリンターセル」です。
闇の中に身を潜め、存在を気づかれることなく任務を成し遂げます。何も見えない暗闇でも視界が明瞭になる「フュージョン・ビジョン」や、視界内のコンピュータにポイントを当てることで、ハッキングして遠隔操作が可能になる装置「EEV（Electronically-Enhanced-Vision）」を駆使して、任務を進めていきましょう。

武器の選択や扉を開ける動作などのガジェット操作は、タッチスクリーンに表示されているアイコンをタッチするだけ。
ボタン操作とタッチ操作を連動して行える2 画面だからこそ、直感的な操作が可能です。